More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1780 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1780  DNA-binding response regulator, putative  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.756985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1595  DNA-binding response regulator, putative  98.64 
 
 		 295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1962  DNA-binding response regulator, putative  98.31 
 
 		 295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0244  conserved hypothetical protein, putative two-component response regulator  59.66 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0408  response regulator receiver domain-containing protein  51.85 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0201  cation-efflux system membrane protein  46.13 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1708  response regulator receiver  48.82 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1488  response regulator receiver domain-containing protein  48.15 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.47127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1466  putative integral membrane protein  47.81 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  30.5 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  28.95 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  38.46 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  27.61 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3062  two-component response regulator CbrB  35.59 
 
 		 463 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  37.04 
 
 		 478 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5443  two-component response regulator CbrB  37.04 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4013  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 467 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0316661  normal  0.37664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.851623  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3589  two-component response regulator CbrB  38 
 
 		 477 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42680  sigma54-dependent response regulator, CbrB  38 
 
 		 466 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 465 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.04 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4695  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 480 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.56 
 
 		 480 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  27.68 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  27.68 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 480 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0737  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 479 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000126889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1675  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.06 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  36.73 
 
 		 478 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0831  response regulator receiver:sigma-54 factor, interaction region  36.73 
 
 		 494 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4808  two-component response regulator CbrB  36 
 
 		 478 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069592  hitchhiker  0.0095877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1254  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 472 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.388952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 223 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  28.21 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15530  heavy metal response regulator, two-component  26.76 
 
 		 227 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  26.32 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  26.32 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  28.21 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  26.89 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 509 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.19 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0973  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  32.56 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.32 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 454 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2037  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.48 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 511 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.2 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1894  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 456 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.410758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  27.59 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0006  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  26.96 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0680  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.736075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0827  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 447 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0984  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 455 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  26.26 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>