More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0149 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0149  RNA methyltransferase  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.913365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0189  RNA methyltransferase  98.68 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0168  RNA methyltransferase  97.79 
 
 		 227 aa  441  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1418  conserved hypothetical protein, probable rRNA methyltransferase, TrmH family  66.37 
 
 		 226 aa  290  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  56.64 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  55.75 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0289  RNA methyltransferase  56.83 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  53.54 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.26 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1908  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.67 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  32.19 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  32.19 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  29.92 
 
 		 323 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  33.9 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  30.84 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.29 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  35.71 
 
 		 288 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1180  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.53 
 
 		 338 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000228447  hitchhiker  0.0000274792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.18 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.66 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  32.7 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  29.03 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  28.94 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  27.47 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  27.35 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.63 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.63 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  30.52 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.28 
 
 		 327 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  32.56 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.13 
 
 		 256 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.75 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.92 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  30.91 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  33.51 
 
 		 312 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.8 
 
 		 248 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.7 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  29.26 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  26.89 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.86 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.48 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  24.45 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.5 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.59 
 
 		 321 aa  85.1  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  33.53 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.64 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.95 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  36.42 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  26.84 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  27.5 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  27.66 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  35.09 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  31.74 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  31.15 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  28.12 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.7 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.82 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.84 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.84 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  33.95 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  27.7 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.42 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  29.17 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.52 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.78 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  32.56 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0310  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.41 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.11 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  32.37 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  32.76 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  31.6 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.58 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.03 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  30.46 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002269  23S rRNA (guanosine-2'-O-) -methyltransferase RlmB  27.39 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  24.68 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  31.91 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  24.68 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.07 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  27.31 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  26.38 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  31.95 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.13 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.82 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.97 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>