More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3604 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  875    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  68.96 
 
 		 423 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 423 aa  565  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  64.65 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 424 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  58.53 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 413 aa  344  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 427 aa  342  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 426 aa  338  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 426 aa  335  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 427 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 422 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  41.71 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 426 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 426 aa  318  7.999999999999999e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 414 aa  316  4e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 452 aa  315  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>