217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1804 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
351 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.64 
 
 
346 aa  289  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.18 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.92 
 
 
353 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.39 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.16 
 
 
355 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.21 
 
 
334 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  36.45 
 
 
364 aa  212  7e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
355 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.61 
 
 
357 aa  182  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  32.2 
 
 
355 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
359 aa  162  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 
355 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
361 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.9 
 
 
346 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.46 
 
 
318 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.01 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.73 
 
 
349 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  30.53 
 
 
371 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.54 
 
 
360 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
328 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.42 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.42 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  31.42 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.91 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.75 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.54 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.38 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.12 
 
 
333 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.57 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.08 
 
 
328 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.45 
 
 
355 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2135  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.79 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000208743  normal  0.172594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.04 
 
 
327 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.74 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.4 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.4 
 
 
335 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.52 
 
 
335 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.48 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.17 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.09 
 
 
331 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.29 
 
 
331 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.17 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.02 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.09 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.09 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.19 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.61 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.15 
 
 
325 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.15 
 
 
325 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.79 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.88 
 
 
326 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.89 
 
 
338 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.21 
 
 
357 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 
322 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.84 
 
 
372 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
374 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.65 
 
 
771 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.29 
 
 
336 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.41 
 
 
331 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.83 
 
 
366 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
335 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.18 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.18 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.47 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.9 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.27 
 
 
335 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.58 
 
 
339 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.5 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.84 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.7 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.87 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.29 
 
 
338 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.28 
 
 
339 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.13 
 
 
792 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.28 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.81 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.81 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.36 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.81 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.92 
 
 
331 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.58 
 
 
338 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.5 
 
 
337 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.46 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.87 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  30.2 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.5 
 
 
363 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.97 
 
 
348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.96 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
325 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
325 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0777  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.97 
 
 
315 aa  113  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.87 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>