More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1531 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  55.91 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2499  translation elongation factor P (EF-P)  56.15 
 
 		 187 aa  221  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  48.13 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  47.59 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  47.06 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  48.13 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  45.99 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  43.48 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  43.85 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  46.45 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  42.7 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  41.94 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  41.62 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  46.81 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  42.7 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  41.4 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.01 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  44.44 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  42.55 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  41.71 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  40.76 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  40.32 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  41.94 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  41.11 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  42.55 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  42.25 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  41.62 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  40 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  41.11 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  40 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  40 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  44.68 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  44.09 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  44.15 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  38.38 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  40 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  38.42 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  39.23 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1658  translation elongation factor P  41.49 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  36.76 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  40.96 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  40.96 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  37.5 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  41.18 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  37.36 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>