More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0841 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  100 
 
 		 374 aa  745    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  40.87 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  39.84 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  34.68 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  39.32 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  30.59 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  37.16 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  36.56 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  34.74 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  32.09 
 
 		 629 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  32.61 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  33.61 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  33.61 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  28.73 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  21.72 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  33.49 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  26.38 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  24.68 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  28.05 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  23.26 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.64 
 
 		 853 aa  89.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  27.85 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  23 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 500 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  31.77 
 
 		 290 aa  86.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  27.73 
 
 		 735 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  24.3 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 919 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  27.13 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  21.45 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  28.64 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  24.02 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  24.48 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  24.48 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  25.68 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 		 1480 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  28.37 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  22.78 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1996  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0327436  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  24.38 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 		 914 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 		 916 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  23.98 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  27.43 
 
 		 455 aa  79.3  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02404  putative sensor protein  29.19 
 
 		 1236 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  22.83 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  26.58 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1927 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  23.92 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  24.89 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 		 1426 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 663 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 845 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 881 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  25.35 
 
 		 1763 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.13 
 
 		 781 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 815 aa  76.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 940 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1116 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.56 
 
 		 789 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1282  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.153514  normal  0.0403413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 		 1768 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  26.52 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  30.33 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  25.23 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  21.45 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>