40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1453 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  51.12 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  265  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  47.78 
 
 		 277 aa  262  6e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  46.67 
 
 		 279 aa  259  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  44.16 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  44.4 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  40.43 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  28.16 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  27.76 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  28.22 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  26.86 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  25.9 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  27.54 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  28.92 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  24.02 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  28.86 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  26.67 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  26.2 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  22.66 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  24.34 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  26.42 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  26.42 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  25.68 
 
 		 321 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  24.18 
 
 		 281 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  26.91 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  22.35 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  23.46 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  26.48 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  24.52 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  25.16 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  22.99 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  23.97 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  23.04 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  33.66 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>