More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0800 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  64.12 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  65.94 
 
 
276 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  60.57 
 
 
282 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  61.62 
 
 
285 aa  358  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1037  signal peptidase I  66.18 
 
 
278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  61.17 
 
 
282 aa  350  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  60.81 
 
 
282 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  60.07 
 
 
283 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  47.37 
 
 
269 aa  258  8e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.85 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  34.52 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  35.27 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  32.32 
 
 
216 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.2 
 
 
199 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.96 
 
 
305 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.12 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.11 
 
 
200 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  35 
 
 
263 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  35 
 
 
263 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.2 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.4 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.59 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  34.8 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.88 
 
 
297 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  34.9 
 
 
297 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  31.77 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  34.52 
 
 
256 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  32.81 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  34.51 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  34.51 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  34.51 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.2 
 
 
251 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.9 
 
 
198 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  32.94 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  32.94 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  34.12 
 
 
325 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  33.73 
 
 
256 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.82 
 
 
305 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  32.93 
 
 
324 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.66 
 
 
219 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  35.63 
 
 
268 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  31.97 
 
 
342 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  33.07 
 
 
325 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  32.4 
 
 
275 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  33.07 
 
 
270 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  32.79 
 
 
321 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.33 
 
 
267 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  35.58 
 
 
321 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  32.94 
 
 
325 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  33.89 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  31.8 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  33.98 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  33.2 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  34.01 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  31.5 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  33.2 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  31.05 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  34.83 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  36.25 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  32.41 
 
 
257 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  33.21 
 
 
324 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  31.37 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.37 
 
 
322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.88 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.98 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.31 
 
 
216 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.95 
 
 
225 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  31.17 
 
 
268 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  31.3 
 
 
268 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  32.94 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  32.39 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  33.07 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  32.79 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  34.45 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  32.28 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.69 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  32.45 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32.38 
 
 
322 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.2 
 
 
219 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  30.99 
 
 
268 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  31.84 
 
 
304 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  33.06 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  33.06 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  33.06 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  33.06 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>