54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10913 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  482  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  42.79 
 
 
237 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  42.29 
 
 
237 aa  187  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  41.05 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  32.19 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
230 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  29.26 
 
 
230 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 
231 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  25.4 
 
 
241 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  27.24 
 
 
252 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  26.22 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  28.85 
 
 
263 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  24.27 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  22.41 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  23.21 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  26.22 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  22.82 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  22.27 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  22.71 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  22.84 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  24.29 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  22.17 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  23.53 
 
 
221 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  20 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  21.84 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  25.74 
 
 
269 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3390  hypothetical protein  22.86 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  28.89 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  27.59 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  28.89 
 
 
265 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.58 
 
 
865 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.16 
 
 
780 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  22.58 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  19.9 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 
400 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  23.05 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 
400 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  24.38 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  32 
 
 
460 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  21.55 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  21.33 
 
 
299 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  22.46 
 
 
311 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  21.83 
 
 
237 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
268 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
253 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  24.11 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>