More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04875 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  100 
 
 		 601 aa  1239    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.23 
 
 		 593 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.36 
 
 		 590 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 590 aa  326  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.33 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.76 
 
 		 586 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.83 
 
 		 610 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  30.9 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  30.9 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.63 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.21 
 
 		 624 aa  261  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.59 
 
 		 607 aa  260  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  29.19 
 
 		 596 aa  257  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  29.12 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.1 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.64 
 
 		 615 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.04 
 
 		 626 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.72 
 
 		 604 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.77 
 
 		 597 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.83 
 
 		 597 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.08 
 
 		 618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.97 
 
 		 597 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.78 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.58 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.58 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  29.05 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  32.52 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.69 
 
 		 243 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  30.4 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.74 
 
 		 443 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  30 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.59 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.07 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.36 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.97 
 
 		 438 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.15 
 
 		 554 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 		 956 aa  97.8  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.67 
 
 		 445 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  29.39 
 
 		 892 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 870 aa  91.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 870 aa  91.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.22 
 
 		 450 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  29.06 
 
 		 931 aa  90.5  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  27.38 
 
 		 869 aa  90.1  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.39 
 
 		 112 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.13 
 
 		 437 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 914 aa  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  24.52 
 
 		 893 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  29.6 
 
 		 874 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  23.69 
 
 		 881 aa  88.2  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  32.37 
 
 		 750 aa  87.8  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  24.92 
 
 		 917 aa  87.8  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 872 aa  87.4  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.76 
 
 		 761 aa  87.4  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  30.39 
 
 		 848 aa  87  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 884 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  25.07 
 
 		 871 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  27.09 
 
 		 895 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 900 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  29.44 
 
 		 871 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 887 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 896 aa  84.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 862 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 862 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  29.21 
 
 		 863 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  28.07 
 
 		 896 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  33.14 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  26.73 
 
 		 854 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  28.36 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 		 873 aa  82  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  25.89 
 
 		 864 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  28.76 
 
 		 886 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  27.45 
 
 		 855 aa  81.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 		 857 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  28.18 
 
 		 918 aa  80.9  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30.61 
 
 		 789 aa  80.5  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 828 aa  80.9  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  26.2 
 
 		 851 aa  80.5  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 881 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  26.5 
 
 		 856 aa  80.5  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 870 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  24.85 
 
 		 897 aa  80.5  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  24.5 
 
 		 859 aa  80.1  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  28.19 
 
 		 1186 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 930 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 932 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  26.34 
 
 		 897 aa  80.1  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  26.97 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 		 874 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 856 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  24.49 
 
 		 867 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  28.65 
 
 		 882 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 881 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 865 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  26.38 
 
 		 846 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 859 aa  79  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>