More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03775 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  872    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  73.05 
 
 		 423 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 423 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 423 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 423 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  54.48 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 420 aa  345  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 422 aa  342  1e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 422 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 423 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 425 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 422 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  44 
 
 		 425 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 431 aa  332  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 427 aa  329  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 422 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 425 aa  326  6e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 426 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 468 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 429 aa  322  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 438 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 438 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1722  seryl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>