More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0324 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0324  putative AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 581 aa  1183    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 553 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.4 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1470  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  27.5 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 532 aa  198  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  28.71 
 
 		 543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 540 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1981  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 521 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  30.31 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.28 
 
 		 518 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  27.34 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.97 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 571 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  28.44 
 
 		 548 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 543 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  29.41 
 
 		 561 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 535 aa  190  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  27.55 
 
 		 547 aa  189  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  27.36 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  28.35 
 
 		 570 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 549 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2996  acyl-CoA synthetase  29.98 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.353714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  27.21 
 
 		 572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  28.12 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.3 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 566 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.53 
 
 		 549 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  29.21 
 
 		 538 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  28.02 
 
 		 552 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 538 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4634  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  27.61 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  27.75 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  29.64 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  29.64 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  28.43 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  29.64 
 
 		 540 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  25.68 
 
 		 549 aa  180  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 551 aa  180  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  27.09 
 
 		 576 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 566 aa  180  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  28.23 
 
 		 575 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  28.37 
 
 		 575 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  26.47 
 
 		 605 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  29.31 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.78 
 
 		 828 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 630 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  27.72 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 662 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  27.29 
 
 		 550 aa  179  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 		 546 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 1043 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4364  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2412  acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 		 567 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  26.72 
 
 		 549 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 843 aa  177  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  28.97 
 
 		 575 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  27.85 
 
 		 578 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  28.48 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 524 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  28.28 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  26.77 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  27.98 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  27.98 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4068  acyl-CoA synthetase  30.65 
 
 		 579 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0302705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  27.99 
 
 		 546 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  28.22 
 
 		 571 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  28.19 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  27.47 
 
 		 576 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  27.32 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  27.49 
 
 		 564 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  25.59 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  27.54 
 
 		 568 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  29.08 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1635  acyl-CoA synthetase  28.99 
 
 		 571 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 500 aa  171  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  25.56 
 
 		 573 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 566 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  27.35 
 
 		 552 aa  170  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  26.8 
 
 		 574 aa  170  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>