More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2358 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
269 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.85 
 
 
271 aa  298  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.371064  hitchhiker  0.00175636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
251 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0928  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.49 
 
 
255 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590061  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.65 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.02 
 
 
271 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
273 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
273 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.2 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
270 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00152285  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
252 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.5 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1929  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  28.22 
 
 
255 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0770518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.678163  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0830301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.700079  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.37 
 
 
262 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.83 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
302 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03220  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.32 
 
 
394 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
275 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
279 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  27.51 
 
 
245 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
245 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0898999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.8 
 
 
280 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
283 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  27.31 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0687  two-component system, permease component  26.61 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0143417  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  32.86 
 
 
300 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.9 
 
 
320 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
319 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  30.94 
 
 
274 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0423  abcb protein  28.45 
 
 
265 aa  109  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  29.09 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  29.09 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  30.94 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5956  ABC transporter permease  27.71 
 
 
245 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  32.39 
 
 
303 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
244 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5785  normal  0.739795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
255 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
284 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
258 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  27.12 
 
 
279 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
269 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
260 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  32.09 
 
 
312 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
257 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
263 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
257 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  27.69 
 
 
275 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  27.69 
 
 
275 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  27.69 
 
 
275 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.78 
 
 
273 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
331 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
283 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
277 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
321 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
281 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
258 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
285 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.92 
 
 
322 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
277 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  29.49 
 
 
264 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  27.37 
 
 
284 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  28.89 
 
 
289 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
253 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
264 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
272 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95605  normal  0.544796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
289 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
275 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
294 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
283 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  34.81 
 
 
295 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
255 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
283 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  28.87 
 
 
283 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.02 
 
 
283 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  29.09 
 
 
263 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  27.69 
 
 
275 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>