More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1461 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
258 aa  516  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  70.47 
 
 
255 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  47.6 
 
 
260 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  47.6 
 
 
260 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  50.64 
 
 
245 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  45.1 
 
 
263 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  42.69 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  44.53 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  40.08 
 
 
272 aa  168  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  52.38 
 
 
196 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  52 
 
 
149 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  45.21 
 
 
152 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  41.1 
 
 
153 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  44.44 
 
 
196 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  41.18 
 
 
174 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.36 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  36.72 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  31.86 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  34.75 
 
 
1585 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 
656 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  36.07 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  32.11 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  34.81 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  33.87 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  34.4 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.05 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  37.5 
 
 
140 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  44.74 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  35.45 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.71 
 
 
762 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  31.58 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  40.19 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  37.7 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.99 
 
 
1061 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  30.41 
 
 
404 aa  65.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
102 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  37.96 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  33.59 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
1198 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 
1030 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
110 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  32.23 
 
 
711 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  39.25 
 
 
174 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  39.25 
 
 
184 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
102 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  28.78 
 
 
4520 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
106 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  32.14 
 
 
483 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  39.62 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  38.32 
 
 
174 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36.89 
 
 
426 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
101 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  32.71 
 
 
891 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  37.5 
 
 
112 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  34.43 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.87 
 
 
1402 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  38.53 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  36.7 
 
 
140 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  38.32 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  35.71 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  34.26 
 
 
583 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  35.11 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  33.91 
 
 
162 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  33.33 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  36.36 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  32.54 
 
 
142 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  39.02 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  31.5 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  35.51 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.76 
 
 
157 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  34.96 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.86 
 
 
2171 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  40.71 
 
 
195 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  35.25 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  34.13 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  33.68 
 
 
103 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  34.26 
 
 
790 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  29.14 
 
 
178 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  33.94 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  30.34 
 
 
811 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  34.92 
 
 
200 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
101 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
101 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
101 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
101 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2058  hypothetical protein  33.6 
 
 
951 aa  58.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  36.45 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
123 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  37.38 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  34.13 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
102 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  34.21 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>