31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3047 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  100 
 
 		 386 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  53.77 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  42.96 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  41.06 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  41.06 
 
 		 378 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  41.06 
 
 		 378 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  40.55 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  36.56 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  35.29 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  36.67 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  33.15 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  32.13 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  32.13 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  32.13 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  32.01 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  28.45 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  31.4 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  29.95 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  29.95 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  30.28 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  28.97 
 
 		 370 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  32.51 
 
 		 249 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  32.49 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  32.05 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  29.44 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  31.22 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  35.37 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  29.01 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  22.71 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  22.71 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  23.85 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>