More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1862 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
645 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  68.31 
 
 
666 aa  942    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
657 aa  683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  71.45 
 
 
665 aa  976    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  51.78 
 
 
649 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.24 
 
 
664 aa  635    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  73.78 
 
 
664 aa  1014    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  72.69 
 
 
660 aa  1035    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  53.02 
 
 
647 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  52.64 
 
 
657 aa  677    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.73 
 
 
664 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  70.33 
 
 
634 aa  963    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  52.24 
 
 
646 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  52.64 
 
 
663 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 
657 aa  681    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  70.22 
 
 
654 aa  973    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 
656 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.44 
 
 
658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  73.29 
 
 
660 aa  1038    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  66.88 
 
 
655 aa  887    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  87.02 
 
 
658 aa  1195    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 
657 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  58.91 
 
 
657 aa  771    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  70.8 
 
 
658 aa  964    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  73.44 
 
 
660 aa  1026    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  74.21 
 
 
664 aa  1027    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  72.49 
 
 
660 aa  1026    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  51.02 
 
 
652 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.16 
 
 
673 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  68 
 
 
664 aa  940    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  56 
 
 
657 aa  701    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.09 
 
 
661 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  60.77 
 
 
653 aa  783    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  52.95 
 
 
651 aa  699    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.56 
 
 
660 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.81 
 
 
656 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  68.6 
 
 
654 aa  960    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  72.34 
 
 
660 aa  1023    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.57 
 
 
645 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  74.42 
 
 
660 aa  1045    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.26 
 
 
654 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  54.72 
 
 
658 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  69.5 
 
 
665 aa  949    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 
647 aa  643    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  74.61 
 
 
660 aa  1010    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  66.25 
 
 
654 aa  885    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  71.16 
 
 
665 aa  983    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
658 aa  1347    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  73.9 
 
 
660 aa  1026    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.44 
 
 
658 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  72.7 
 
 
633 aa  997    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.09 
 
 
660 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.05 
 
 
643 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  52.64 
 
 
657 aa  673    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  72.53 
 
 
660 aa  1028    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.65 
 
 
652 aa  688    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.03 
 
 
655 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.63 
 
 
658 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.01 
 
 
660 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  73.94 
 
 
664 aa  1016    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  72.19 
 
 
660 aa  1018    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  54.57 
 
 
655 aa  710    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54.02 
 
 
644 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  74.42 
 
 
660 aa  1049    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
655 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  73.34 
 
 
660 aa  1023    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  71.69 
 
 
655 aa  998    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 
645 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  67.92 
 
 
666 aa  955    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  71.02 
 
 
660 aa  1026    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  72.8 
 
 
660 aa  1032    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  74.21 
 
 
664 aa  1027    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  70.94 
 
 
657 aa  1001    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  53.25 
 
 
645 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  68.08 
 
 
664 aa  927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  52.11 
 
 
655 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  72.19 
 
 
660 aa  1018    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  73.94 
 
 
664 aa  1016    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  54.57 
 
 
655 aa  710    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.71 
 
 
650 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3375  acetyl-CoA synthetase  50.69 
 
 
653 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  55.48 
 
 
667 aa  658    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  71.29 
 
 
660 aa  955    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.98 
 
 
658 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  72.95 
 
 
660 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  75 
 
 
680 aa  1019    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.4 
 
 
660 aa  687    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0685  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
653 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  71.29 
 
 
665 aa  974    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.04 
 
 
664 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.55 
 
 
656 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  72.34 
 
 
660 aa  1018    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  53.18 
 
 
650 aa  638    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  69.65 
 
 
664 aa  957    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>