45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4074 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  100 
 
 		 842 aa  1633    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  47.63 
 
 		 848 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  55.73 
 
 		 639 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  49.36 
 
 		 835 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  49.66 
 
 		 787 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  52.25 
 
 		 871 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  52 
 
 		 874 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  50.5 
 
 		 904 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  48.51 
 
 		 941 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  46.53 
 
 		 857 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  48.49 
 
 		 915 aa  360  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  49.75 
 
 		 799 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  46.62 
 
 		 907 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  49.75 
 
 		 799 aa  359  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  46.31 
 
 		 857 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  47.52 
 
 		 856 aa  354  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  46.67 
 
 		 846 aa  352  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  47.03 
 
 		 857 aa  350  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  46.78 
 
 		 856 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  46.94 
 
 		 858 aa  340  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  44.3 
 
 		 769 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  47.29 
 
 		 855 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  44.47 
 
 		 762 aa  319  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  42.96 
 
 		 719 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  52.48 
 
 		 367 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  52.48 
 
 		 367 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  41.39 
 
 		 740 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  37.73 
 
 		 741 aa  246  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  40.46 
 
 		 790 aa  234  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  37.06 
 
 		 680 aa  217  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  34.11 
 
 		 704 aa  167  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  34.73 
 
 		 472 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  29.36 
 
 		 438 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  24.65 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  32.24 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  26.58 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  34.02 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  34.02 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  33.71 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  31.62 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  25.5 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  30.77 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  37.4 
 
 		 341 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.4 
 
 		 925 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  24.3 
 
 		 10203 aa  45.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>