More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3290 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3290  amidase  100 
 
 		 431 aa  855    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  60.14 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  48.64 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  46.81 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  50.14 
 
 		 421 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4589  Amidase  48.1 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4799  amidase  44.24 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  42.55 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  42.76 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  38.35 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  40.09 
 
 		 467 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  44.96 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  38.07 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  42.86 
 
 		 413 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  42.48 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  35.51 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  41.55 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  41.19 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0343  amidase  39.14 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  41.19 
 
 		 452 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3419  amidase  39.67 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  38.33 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  39.11 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  35.17 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  38.63 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6302  amidase  37.16 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.5 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.33 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.36 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.34 
 
 		 491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  31.46 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.28 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.09 
 
 		 499 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  32.65 
 
 		 447 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.42 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.44 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.17 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.81 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  37.37 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.73 
 
 		 480 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.76 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  32.13 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.17 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.51 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.8 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  30.5 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.96 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.74 
 
 		 498 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  34.01 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.03 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.37 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  29.41 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  32.52 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  32.18 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3381  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.84 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.41 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  30.6 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.08 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  32.79 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  30.89 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.68 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4188  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.55 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.834018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  29.85 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.48 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.67 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.85 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  29.36 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  31.84 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4320  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.41 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 		 495 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0846  amidohydrolase, AtzE family  33.11 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1438  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.18 
 
 		 485 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  29.8 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.86 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.25 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.79 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4342  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.2 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1989  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.76 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1955  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.76 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  32.13 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.56 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  32.46 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.57 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4338  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.32 
 
 		 490 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.68 
 
 		 489 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4787  Amidase  32.52 
 
 		 516 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  33.97 
 
 		 450 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.96 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  32.68 
 
 		 388 aa  143  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.34 
 
 		 486 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2379  amidase  31.78 
 
 		 480 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.732012  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.34 
 
 		 486 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  31.65 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  32.4 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1007  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.08 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.18 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  30.18 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.3 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  31.07 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.83 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>