73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2563 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  100 
 
 
312 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  76.97 
 
 
315 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  69.23 
 
 
313 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  68.42 
 
 
318 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  68.81 
 
 
312 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  64.72 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  64.72 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  48.56 
 
 
318 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  47.28 
 
 
318 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  48.55 
 
 
311 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  47.8 
 
 
318 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  49.04 
 
 
310 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  46.93 
 
 
310 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  47.57 
 
 
310 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  46.79 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  45.51 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  45.51 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  43.27 
 
 
310 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  46.77 
 
 
311 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  36.69 
 
 
310 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  28.57 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  27.51 
 
 
239 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 
263 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  27.7 
 
 
264 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25.13 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25.13 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.26 
 
 
225 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  26.67 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
368 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.67 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.3 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  25.77 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  27.37 
 
 
221 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.49 
 
 
221 aa  52.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  29.02 
 
 
231 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.82 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  25.26 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  26.67 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  27.91 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.52 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  25.5 
 
 
246 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  28.1 
 
 
229 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  27.93 
 
 
221 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  25.45 
 
 
224 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  22.58 
 
 
232 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.8 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  25.62 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  27 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  32.32 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  25.77 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  25.58 
 
 
236 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.23 
 
 
220 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  24.24 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  28.5 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  27.44 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  27.78 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  24.15 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  23.77 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  26.48 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  22.22 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.08 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.41 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  26.46 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  23.6 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  26.92 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  28.09 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 
225 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27 
 
 
220 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  31.37 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
221 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  31.37 
 
 
249 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  25.82 
 
 
209 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>