82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4730 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  86.59 
 
 		 180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  41.71 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  33.72 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  35.76 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  36.99 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  35.88 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  34.27 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  31.76 
 
 		 165 aa  87.8  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  33.14 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  32.95 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  34.57 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  35.37 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  33.52 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  31.18 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  33.53 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  29.44 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  34.15 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  30.81 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  29.89 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  34.5 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  31.76 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  31.76 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  33.14 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  32.19 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  31.58 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  30.99 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  30.99 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  30.99 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  31.93 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  28.74 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  30 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  31.33 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  27.93 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  27.78 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  31.14 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  26.42 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  28.24 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  30 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  32.1 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  30.06 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  25.95 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  24.34 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  31.51 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  27.98 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  27.08 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  30.77 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  27.08 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  26.56 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  25.68 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  25.77 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  25 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  28.19 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  35.21 
 
 		 90 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  26.49 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  26.26 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  26.26 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  27.46 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  26.26 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  28.57 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  29.81 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0390  carbonic anhydrase  30.91 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  30 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  21.76 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  30.63 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  27.46 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  28 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  27.32 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  29.34 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  30.25 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  29.81 
 
 		 221 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  28.26 
 
 		 193 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  30.36 
 
 		 211 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  28.25 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  30.99 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  30.38 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  26.37 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  22.92 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  28.43 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  27.17 
 
 		 215 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>