124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4074 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  74.15 
 
 
468 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  74.57 
 
 
495 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  72.61 
 
 
458 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  72.44 
 
 
504 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  91.89 
 
 
456 aa  865    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  73.91 
 
 
458 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  72.83 
 
 
458 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  73.91 
 
 
458 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  74.36 
 
 
468 aa  706    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  74.36 
 
 
517 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  74.57 
 
 
468 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  74.57 
 
 
468 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  74.36 
 
 
468 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  73.68 
 
 
454 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  73.48 
 
 
458 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  72.39 
 
 
458 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  100 
 
 
456 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  64.64 
 
 
462 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  52 
 
 
438 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  49.08 
 
 
444 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  49.17 
 
 
453 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  48.51 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  49.41 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.89 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  49.3 
 
 
444 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.41 
 
 
439 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  48.04 
 
 
444 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.3 
 
 
435 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  47.81 
 
 
444 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  47.54 
 
 
443 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.71 
 
 
452 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  47.39 
 
 
443 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  49.42 
 
 
458 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  44.84 
 
 
446 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.81 
 
 
442 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.56 
 
 
445 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.89 
 
 
432 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  39.12 
 
 
498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  40.6 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.6 
 
 
444 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  39.29 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.02 
 
 
422 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38 
 
 
448 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.51 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.39 
 
 
445 aa  254  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.8 
 
 
463 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.62 
 
 
444 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  34.85 
 
 
451 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2151  lysine/ornithine N-monooxygenase  35.76 
 
 
431 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  34.71 
 
 
445 aa  219  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3655  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.95 
 
 
446 aa  216  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  35.17 
 
 
451 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141166  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  33.64 
 
 
440 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  33.33 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.92 
 
 
471 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6165  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.87 
 
 
434 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.33 
 
 
505 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  30.86 
 
 
421 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.528948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.8 
 
 
431 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  32.39 
 
 
427 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.79 
 
 
502 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.21 
 
 
446 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  29.3 
 
 
498 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  31.38 
 
 
427 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.96 
 
 
442 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  28.76 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  32.24 
 
 
438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.07 
 
 
457 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.78 
 
 
428 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.88 
 
 
435 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.83 
 
 
456 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.58 
 
 
428 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.49 
 
 
434 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.97 
 
 
496 aa  170  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.48 
 
 
432 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.79 
 
 
437 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.18 
 
 
455 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.7 
 
 
502 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.67 
 
 
495 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.33 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  28.5 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.54 
 
 
505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  27.73 
 
 
442 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.14 
 
 
454 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.42 
 
 
426 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  29.05 
 
 
468 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.42 
 
 
441 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  32.31 
 
 
434 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.54 
 
 
449 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.22 
 
 
437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.31 
 
 
501 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.03 
 
 
445 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  29.13 
 
 
437 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.1 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.07 
 
 
501 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.5 
 
 
501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.31 
 
 
425 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.34 
 
 
442 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.74 
 
 
442 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.04 
 
 
442 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>