52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2747 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
190 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  42.31 
 
 
181 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  40.51 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  40.83 
 
 
175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
200 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  37.5 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  40 
 
 
193 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  41.06 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  38.85 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  40.67 
 
 
176 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 
170 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  33.71 
 
 
176 aa  104  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  29.32 
 
 
190 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  32 
 
 
190 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  34.32 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  34.73 
 
 
178 aa  97.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  34.29 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  30.72 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  95.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  32.77 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  29.34 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  29.52 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  28.74 
 
 
176 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  28.76 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  31.64 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  33.15 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  27.71 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  32.12 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  25.29 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  28.31 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  36.84 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  29.92 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  22.64 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  28.24 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  20.41 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
306 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02360  expressed protein  23.85 
 
 
371 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
146 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10158  conserved hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  29.07 
 
 
215 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>