More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1107 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
700 aa  1433    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.55 
 
 
682 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.92 
 
 
684 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.21 
 
 
713 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.77 
 
 
684 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.12 
 
 
689 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  44.28 
 
 
691 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.99 
 
 
690 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  46.36 
 
 
692 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  46.36 
 
 
692 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.47 
 
 
687 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.01 
 
 
687 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.71 
 
 
691 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  42.25 
 
 
676 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.15 
 
 
686 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.34 
 
 
668 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.4 
 
 
678 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.03 
 
 
681 aa  475  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  39.22 
 
 
711 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  39.89 
 
 
678 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.16 
 
 
675 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  37.67 
 
 
674 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.73 
 
 
678 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.81 
 
 
676 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.16 
 
 
321 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  49.37 
 
 
316 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.58 
 
 
321 aa  290  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.9 
 
 
820 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  32.53 
 
 
627 aa  270  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.86 
 
 
323 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.08 
 
 
445 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.1 
 
 
307 aa  240  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.98 
 
 
412 aa  239  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  43.04 
 
 
310 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.95 
 
 
311 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.47 
 
 
310 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.06 
 
 
414 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.17 
 
 
399 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.17 
 
 
714 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.44 
 
 
317 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  41.46 
 
 
330 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  44.58 
 
 
410 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  44.58 
 
 
419 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  41.75 
 
 
310 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.86 
 
 
390 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.76 
 
 
305 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.93 
 
 
306 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.13 
 
 
307 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.86 
 
 
313 aa  207  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.5 
 
 
306 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.84 
 
 
353 aa  204  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  35.55 
 
 
596 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41 
 
 
308 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.14 
 
 
304 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  35.43 
 
 
581 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  34.53 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  33.24 
 
 
586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  42.04 
 
 
397 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  42.04 
 
 
397 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  40.49 
 
 
396 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  40.49 
 
 
396 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  40.49 
 
 
396 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  40.49 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  34 
 
 
590 aa  181  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 
403 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  37.07 
 
 
394 aa  180  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  40.49 
 
 
396 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  36.86 
 
 
394 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  38.46 
 
 
396 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  38.75 
 
 
403 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  36.51 
 
 
402 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  37.26 
 
 
305 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 
396 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  35.71 
 
 
402 aa  177  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 
396 aa  177  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  40.64 
 
 
396 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  42.68 
 
 
397 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  38.8 
 
 
402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  39.68 
 
 
396 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
402 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  35.71 
 
 
402 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  38.46 
 
 
396 aa  175  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  39.22 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  41.87 
 
 
397 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
402 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  42.28 
 
 
397 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
402 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  35.71 
 
 
402 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
402 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
402 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  40.64 
 
 
396 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
402 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  39.34 
 
 
504 aa  171  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  33.24 
 
 
586 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>