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for query gene Bphy_5000 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  75.93 
 
 		 499 aa  770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  71.9 
 
 		 541 aa  757    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  100 
 
 		 535 aa  1064    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  73.37 
 
 		 537 aa  782    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  53.47 
 
 		 530 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 544 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  54.34 
 
 		 513 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  53.54 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 511 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 		 509 aa  505  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  53.36 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 		 553 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  50.48 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.51 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 522 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  41.08 
 
 		 498 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  39.91 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 522 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  29.96 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  28.95 
 
 		 499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.44 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  28.72 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 		 517 aa  193  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 535 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.8 
 
 		 542 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.8 
 
 		 542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 535 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 		 539 aa  181  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 516 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 543 aa  180  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.29 
 
 		 539 aa  179  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 		 527 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.83 
 
 		 539 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 516 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.83 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 526 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.31 
 
 		 529 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  25.29 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.72 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 527 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 532 aa  156  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  26.78 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.3 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  23.46 
 
 		 524 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.85 
 
 		 504 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.83 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.07 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  26.49 
 
 		 503 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.45 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.2 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.75 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.85 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 		 517 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
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NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.78 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.99 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
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NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.99 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.99 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.23 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.95 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_0954  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 517 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.71 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
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