More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4556 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4556  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.972844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1062  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  93.15 
 
 
219 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790133  normal  0.732766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0154  amino acid ABC transporter permease  41.23 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0413  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  39.05 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.739414  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  34.88 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  37.91 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
503 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3795  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1149  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
503 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0905  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 
218 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1955  amino acid ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  30.1 
 
 
246 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
217 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1881  amino acid ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
232 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.66 
 
 
216 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
242 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
489 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.96 
 
 
217 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  35.84 
 
 
489 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
489 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.18 
 
 
485 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.41 
 
 
219 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
227 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709635  normal  0.465789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.67 
 
 
219 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.18 
 
 
485 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.1 
 
 
236 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 
219 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1987  amino acid ABC transporter permease  38.41 
 
 
223 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45101  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  35.23 
 
 
225 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1552  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
230 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1516  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  28.71 
 
 
223 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219421  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  32.63 
 
 
230 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.07 
 
 
490 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 
216 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.32 
 
 
233 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.55 
 
 
216 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3382  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.72 
 
 
217 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281722  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  34.32 
 
 
219 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
219 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  34.32 
 
 
219 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  34.32 
 
 
219 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  34.32 
 
 
219 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
225 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.16 
 
 
217 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.192626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.33 
 
 
223 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
230 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  34.32 
 
 
230 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3381  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
218 aa  101  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.782136  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2764  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
548 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1072  amino acid ABC transporter permease  35.71 
 
 
240 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  29.65 
 
 
232 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  33.17 
 
 
225 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.41 
 
 
216 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 
233 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1680  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
230 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0758513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  32.29 
 
 
223 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
259 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  32.63 
 
 
251 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1528  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
230 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1820  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
229 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.164936  hitchhiker  0.000000016606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
259 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1609  amino acid ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
221 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4694  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586539  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.48 
 
 
221 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1958  amino acid ABC transporter permease  31.18 
 
 
231 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.543983 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0446  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  36.18 
 
 
264 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.06 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  28.96 
 
 
485 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1028  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0187764 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4340  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  31.43 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.06 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4026  amino acid ABC transporter permease  35.71 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  31.82 
 
 
273 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1186  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
222 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1632  ABC-type amino acid transport system, permease component  33.33 
 
 
214 aa  99  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.68 
 
 
335 aa  98.6  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0315  putative ABC transporter permease protein  35.43 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000179875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
321 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  33.83 
 
 
319 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5510  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.08 
 
 
324 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.442153  decreased coverage  0.000455607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.55 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
320 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.06 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646385  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6013  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.31 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.39 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  29.41 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3744  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  29.41 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  37.5 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.088801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
321 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.376143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>