126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3102 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  100 
 
 
198 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  75.51 
 
 
196 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  73.98 
 
 
196 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  69.9 
 
 
195 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  61.73 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  61.73 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  62.89 
 
 
195 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  61.22 
 
 
195 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  60.2 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  59.69 
 
 
195 aa  234  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  57.65 
 
 
195 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  61.86 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  59.28 
 
 
192 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  58.67 
 
 
195 aa  225  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  60.31 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  60.31 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  60.31 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  59.79 
 
 
194 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  62.22 
 
 
194 aa  224  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  60.31 
 
 
196 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  58.67 
 
 
194 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  58.76 
 
 
194 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  58.76 
 
 
194 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  57.14 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  58.67 
 
 
194 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  57.14 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  58.76 
 
 
194 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  58.76 
 
 
194 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  58.76 
 
 
194 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  57.14 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  56.63 
 
 
195 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  61.8 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  61.8 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  58.76 
 
 
194 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  55.61 
 
 
195 aa  217  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  57.22 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  56.74 
 
 
200 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  55.9 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  52.28 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  51.26 
 
 
231 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  55.06 
 
 
205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  51.74 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  53.93 
 
 
205 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  59.62 
 
 
195 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  53.53 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  45.57 
 
 
183 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  43.15 
 
 
189 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  46.71 
 
 
190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  42.11 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  57.85 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  48.34 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  48.34 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  41.77 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  47.68 
 
 
185 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 
187 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  45.03 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  41.1 
 
 
185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  42.38 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  39.24 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  40.97 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 
185 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  39.38 
 
 
197 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  36.63 
 
 
327 aa  79  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  35.51 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  34.78 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  33.77 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  34.07 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  34.59 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  37.23 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  31.58 
 
 
301 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  31.82 
 
 
301 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  35.04 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  28.4 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  29.79 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  28.49 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  36.84 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  34.07 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  34.62 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  36.15 
 
 
257 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  31.51 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  32.82 
 
 
297 aa  58.2  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  34.35 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  33.87 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  32.09 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  25.74 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  32.09 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  28.25 
 
 
225 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  35.34 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  28.78 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  31.11 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  25.62 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  31.85 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  32.26 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>