More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2159 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.19 
 
 		 438 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  889    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.48 
 
 		 439 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  83.94 
 
 		 439 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.42 
 
 		 438 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.88 
 
 		 438 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  74.88 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.88 
 
 		 438 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  75 
 
 		 437 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  75 
 
 		 437 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  74.77 
 
 		 437 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  74.32 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  74.32 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  74.32 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  74.32 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  74.15 
 
 		 437 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.65 
 
 		 438 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.54 
 
 		 421 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  45.69 
 
 		 429 aa  362  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  44.26 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  43.54 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.64 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  39.26 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.22 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.22 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  29.77 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  29.44 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  31.55 
 
 		 471 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  29.21 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  29.25 
 
 		 438 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  36.47 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  36.47 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  32.82 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  30.72 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  30.72 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  32.05 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  29.02 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  28.8 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  33.03 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  28.8 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  29.24 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  28.8 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  30.69 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  28.12 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  30.28 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.89 
 
 		 453 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  36.05 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  30.59 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.9 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  31.46 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  31.66 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  32.13 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30.32 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  31.56 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  32.68 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  32.57 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  26.58 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  30.09 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  30.67 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  29.87 
 
 		 523 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  29.3 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  29.3 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  29.3 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  29.3 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.19 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  29.11 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  29.24 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 450 aa  146  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  29.64 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  29.19 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  29.71 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  31.83 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>