More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1021 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1021  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 433 aa  878    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1916  D-amino-acid dehydrogenase  73.15 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2285  D-amino-acid dehydrogenase  72.16 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1833  D-amino-acid dehydrogenase  63.59 
 
 		 434 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1938  D-amino-acid dehydrogenase  63.74 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1903  D-amino-acid dehydrogenase  63.36 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.612686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5216  D-amino-acid dehydrogenase  63.51 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6164  D-amino-acid dehydrogenase  63.28 
 
 		 433 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1915  D-amino-acid dehydrogenase  63.28 
 
 		 433 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2134  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  62.77 
 
 		 434 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0270937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1359  D-amino-acid dehydrogenase  63.13 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385904  normal  0.690046 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1212  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  61.81 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2305  D-amino-acid dehydrogenase  62.05 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1447  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  61.81 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3366  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  61.81 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2464  putative D-amino acid dehydrogenase small subunit  62.05 
 
 		 506 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1939  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  61.81 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2344  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  62.05 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1877  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000325686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1981  D-amino-acid dehydrogenase  33.11 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  31.59 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  30.72 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  29.43 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1987  D-amino-acid dehydrogenase  32.62 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  30.72 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  30.44 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  32.43 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  32.2 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0385  D-amino-acid dehydrogenase  29.95 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  29.82 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.92 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  29.72 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  29.72 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  27.85 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.09 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.47 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  27.83 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  27.83 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.08 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.77 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1822  D-amino-acid dehydrogenase  31.82 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  28.89 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.5 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  26.92 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.84 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1756  D-amino-acid dehydrogenase  28.4 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.141509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.84 
 
 		 434 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.84 
 
 		 434 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.42 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.94 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.33 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.17 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.17 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  26.17 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.18 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.17 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.17 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.17 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.59 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.01 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.01 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.42 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.2 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.2 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.6 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.8 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  25.11 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.67 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.48 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.85 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  26.77 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.63 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  28.27 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.83 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.12 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.98 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.63 
 
 		 429 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.44 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.98 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.86 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.835424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.3 
 
 		 416 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.74 
 
 		 436 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>