More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0664 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0664  recombination protein RecR  100 
 
 
203 aa  411  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  46.28 
 
 
203 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.35 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  43.01 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  45.95 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  42.35 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  43.78 
 
 
200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  42.86 
 
 
199 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  42.49 
 
 
219 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  41.33 
 
 
199 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  40.51 
 
 
198 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  40.51 
 
 
198 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  45.5 
 
 
204 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  42.27 
 
 
192 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  40.51 
 
 
198 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  40.31 
 
 
198 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  41.03 
 
 
199 aa  168  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  44.75 
 
 
182 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  44.02 
 
 
182 aa  168  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  38.39 
 
 
215 aa  168  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  39.71 
 
 
205 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  41.03 
 
 
199 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  41.67 
 
 
206 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  41.75 
 
 
205 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  41.24 
 
 
200 aa  165  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  39.5 
 
 
198 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  42.78 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  40.84 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  39.29 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  40.31 
 
 
198 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  40.82 
 
 
198 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  40.51 
 
 
199 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  40.82 
 
 
198 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  39.5 
 
 
199 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  41.15 
 
 
205 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  39.49 
 
 
197 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  39.49 
 
 
197 aa  160  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  40.31 
 
 
198 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  38.38 
 
 
199 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  42.39 
 
 
182 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  42.47 
 
 
189 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  38.78 
 
 
198 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  40.41 
 
 
199 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  40.1 
 
 
198 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  40.1 
 
 
198 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  40.51 
 
 
198 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  40.61 
 
 
194 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  41.85 
 
 
182 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  40.61 
 
 
211 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  39.8 
 
 
199 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  42.19 
 
 
198 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  40.51 
 
 
198 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  42.7 
 
 
205 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  39.13 
 
 
199 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  42.56 
 
 
207 aa  156  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  35.03 
 
 
198 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  39.06 
 
 
204 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  40.64 
 
 
206 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  36.98 
 
 
199 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  40.64 
 
 
189 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  36.98 
 
 
199 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  39.06 
 
 
204 aa  154  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  37.24 
 
 
204 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  37.5 
 
 
197 aa  154  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  39.09 
 
 
201 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  38.19 
 
 
199 aa  154  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  39.09 
 
 
200 aa  154  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  40.22 
 
 
199 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  39.5 
 
 
197 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  38.38 
 
 
198 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  41.67 
 
 
198 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  39.01 
 
 
199 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  37.44 
 
 
199 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  36.36 
 
 
199 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  38.04 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  35.23 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0414  recombination protein RecR  42.56 
 
 
195 aa  152  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  37.24 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  39.09 
 
 
195 aa  151  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  39.9 
 
 
200 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  37.5 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  34.9 
 
 
202 aa  150  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  38.04 
 
 
199 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1469  recombination protein RecR  38.19 
 
 
197 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  37.76 
 
 
198 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  34.9 
 
 
198 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  38.34 
 
 
195 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  33.33 
 
 
200 aa  148  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  37.5 
 
 
198 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  37.95 
 
 
201 aa  148  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>