More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4749 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4749  amino acid permease-associated region  100 
 
 
474 aa  935    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685985  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  59.78 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  61.38 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  60.84 
 
 
461 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  59.91 
 
 
460 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  61.28 
 
 
461 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  59.91 
 
 
460 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  59.91 
 
 
460 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  61.28 
 
 
485 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  60.09 
 
 
459 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  59.52 
 
 
460 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  60.62 
 
 
485 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  62.24 
 
 
447 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  62.24 
 
 
447 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  62.24 
 
 
447 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  60.66 
 
 
471 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  56.77 
 
 
463 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  58.3 
 
 
463 aa  541  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  58.3 
 
 
463 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  58.3 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  58.3 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  58.3 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  58.3 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  58.3 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  58.3 
 
 
463 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  58.3 
 
 
463 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  58.96 
 
 
472 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  58.74 
 
 
468 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  58.96 
 
 
472 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  57.85 
 
 
463 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  59.13 
 
 
468 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  59.13 
 
 
468 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  59.13 
 
 
468 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  58.32 
 
 
472 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  58.9 
 
 
468 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  58.9 
 
 
468 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  58.9 
 
 
468 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  60.23 
 
 
472 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  58.9 
 
 
468 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  59.78 
 
 
473 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  58.33 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  57.82 
 
 
471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  52.63 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  52.65 
 
 
468 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  47.95 
 
 
461 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1788  amino acid permease family protein  48.39 
 
 
463 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  49.67 
 
 
475 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3168  amino acid permease-associated region  48.62 
 
 
463 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.206651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3471  amino acid permease  48.17 
 
 
472 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0414864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3262  amino acid permease family protein  47.94 
 
 
472 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000532253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3459  amino acid permease family protein  48.17 
 
 
463 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3516  amino acid permease family protein  47.94 
 
 
463 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3477  amino acid permease family protein  47.94 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3490  amino acid permease family protein  47.94 
 
 
463 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.175253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3234  amino acid permease  47.71 
 
 
472 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.42429e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3176  amino acid permease  47.71 
 
 
472 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000126504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  51.26 
 
 
463 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  48.56 
 
 
463 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  48.21 
 
 
462 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  49.11 
 
 
458 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  47.82 
 
 
463 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  49.2 
 
 
455 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  46.2 
 
 
467 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  48.15 
 
 
467 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  48.16 
 
 
463 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  47.93 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  47.93 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  47.32 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  48.39 
 
 
467 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3101  putative proline-specific permease  48.44 
 
 
450 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  48.16 
 
 
467 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  48.77 
 
 
458 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  48.97 
 
 
454 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  48.07 
 
 
467 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  47.81 
 
 
495 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  48.74 
 
 
467 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4141  putative transport protein YifK  46.62 
 
 
461 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000118516  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  49.1 
 
 
459 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4259  putative transport protein YifK  46.62 
 
 
461 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000481193  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4156  putative transport protein YifK  46.62 
 
 
461 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000110979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4318  putative transport protein YifK  46.72 
 
 
460 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0011437  normal  0.877333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  47.84 
 
 
455 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  48.74 
 
 
467 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  48.74 
 
 
472 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4210  putative transport protein YifK  46.62 
 
 
461 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000256233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  47.01 
 
 
467 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  48.57 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  48.57 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0213  putative transport protein YifK  46.73 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  48.79 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  48.97 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  48.97 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  47.61 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  49.55 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  48.97 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  48.97 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  48.97 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  48.97 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  48.57 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0467  amino acid transporter  48.97 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00613549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>