45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3128 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  100 
 
 		 166 aa  340  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  70.75 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  51.53 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  48.45 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  49.28 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  61.61 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  47.06 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  51.68 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  56.82 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  58.87 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  55.2 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  46.05 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  43.41 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  46.27 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  39.66 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  44.53 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  37.69 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  44.19 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  48 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  38.52 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  33.77 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  40.31 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  34.44 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  32.32 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  36.17 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  40.6 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  33.58 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  40.46 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  33.33 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  35.86 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  35.86 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  29.77 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  29.37 
 
 		 738 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  33.54 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  31.75 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 		 730 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 752 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  32.2 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  29.13 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  30.95 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  27.56 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  30.95 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>