49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1753 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
172 aa  350  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  43.23 
 
 
170 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  40.46 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  34.21 
 
 
159 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  35.33 
 
 
181 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
190 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  30.92 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  29.59 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  34.75 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  32.41 
 
 
197 aa  85.1  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  30.13 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  34.59 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  34.4 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  29.53 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  43.18 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  32.14 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  29.7 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  35.2 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  28.14 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  28.93 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  29.71 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  28.38 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  30.66 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  28.31 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  29.8 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  29.93 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  28.67 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  28.05 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  28.99 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  32 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  24.17 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  25.25 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  24.31 
 
 
187 aa  52  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  28.91 
 
 
734 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02360  expressed protein  21.82 
 
 
371 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880113  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  21.54 
 
 
306 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>