294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1000 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 111 aa  221  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  66.97 
 
 		 111 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  72.32 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  69.72 
 
 		 111 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  62.39 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  62.39 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  55.45 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  58.18 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  57.66 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  60.38 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  56.88 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  60.36 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  55.05 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  66.67 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  51.82 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  62.92 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  54.13 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  52.29 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  51.82 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  55.91 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  57.14 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  61.36 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  55.21 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  52.99 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  52.04 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  56.32 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  50.56 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  56.1 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  48.94 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  49.09 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  50.57 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  40.71 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  52.44 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  45.63 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  53.16 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  48.45 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  36.21 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  38.89 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  38.89 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  39.81 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  43.64 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  40.95 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  43.01 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.89 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  39.78 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  46.25 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  43.52 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  40.38 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  41.84 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>