33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0802 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 
194 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.43 
 
 
203 aa  194  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.43 
 
 
187 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.17 
 
 
186 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.27 
 
 
188 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.81 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.67 
 
 
213 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.31 
 
 
189 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  44.39 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.62 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.18 
 
 
185 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.95 
 
 
186 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  43.51 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.51 
 
 
208 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.64 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.32 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.62 
 
 
162 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.83 
 
 
196 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  42.95 
 
 
172 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.24 
 
 
173 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.28 
 
 
172 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.86 
 
 
172 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  40.82 
 
 
161 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.18 
 
 
161 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.18 
 
 
161 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.89 
 
 
160 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  39.74 
 
 
166 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.72 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  30.67 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.43 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.71 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.19 
 
 
406 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>