270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0554 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  100 
 
 		 312 aa  634    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  63.51 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  61.94 
 
 		 301 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  61.13 
 
 		 300 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  60.78 
 
 		 300 aa  361  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  60.55 
 
 		 301 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  59.72 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  57.14 
 
 		 318 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  58.33 
 
 		 298 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  57.53 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  58.33 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  58.16 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  56.23 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  57.49 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  56.79 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  56.74 
 
 		 316 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  54.55 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  55.78 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  55.9 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  56.06 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  54.13 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  53.45 
 
 		 304 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  51.68 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  48.94 
 
 		 381 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  50.35 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.19 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  51.96 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  49.65 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  51.55 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  46.55 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  46.05 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  48.4 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  48.4 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  48.4 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  46.51 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  47.72 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  45.42 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  44.22 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  45.71 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  44.53 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  42.18 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  42.41 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.31 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  39.24 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  39.24 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  38.89 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  38.89 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  38.89 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  38.89 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  38.89 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  39.12 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  39.1 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  39.35 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  40.06 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  41.84 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  40.66 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  40 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.44 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  40.26 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  36.46 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  37.96 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  39.29 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  39.61 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.27 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  38.44 
 
 		 315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  38.33 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  39.47 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  36.82 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  37.91 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  35.74 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  37.91 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  35.74 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  36.36 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  35.84 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  37.13 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  37.31 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  35.74 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  38.29 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.53 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.53 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.53 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  36.19 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  35.89 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  36.94 
 
 		 277 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  35.89 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  35.89 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  36.07 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  37.01 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  35.89 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  34.03 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  35.54 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  35.54 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  35.54 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  35.54 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  36.07 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  35.61 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  35.86 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  32.87 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  37.01 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>