More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0208 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 331 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  60.49 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  60.12 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  59.27 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  58.18 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  56.19 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  55.59 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  55.29 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  50.76 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  50.46 
 
 		 323 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  53.66 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  51.38 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  51.38 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  51.83 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  51.38 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  51.38 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  47.27 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  47.81 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  44.21 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  50.36 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  33.13 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  33.13 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  44.9 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  36.9 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.9 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.25 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.9 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.95 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.95 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  36.34 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.25 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  39.53 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  41.62 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  37.29 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  42.09 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  42.09 
 
 		 361 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.99 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  35.99 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.63 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  40.82 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  37.72 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.13 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.43 
 
 		 329 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  37.43 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  38.75 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  40.59 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  41.37 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  39.42 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  38.92 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  39.04 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  40.72 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  39.63 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  40.47 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  37.58 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  33.83 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  40.42 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.23 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.23 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  38.54 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.79 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  43 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  37.87 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  41.13 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  40.28 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.41 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  37.84 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  40.06 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.49 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  37.42 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  35.93 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.7 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  40.85 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  40.49 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  38.48 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  34.64 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  44.66 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  41.94 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  40.59 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  41.38 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  40.59 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  40.21 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.47 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  36.86 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>