More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
353 aa  677    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.15 
 
 
333 aa  276  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109315  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.35 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1055  ABC transporter related  44.3 
 
 
334 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.758916  normal  0.126684 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0586  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 
303 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5083  ABC transporter related  42.07 
 
 
320 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16913  hitchhiker  0.000556999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0476  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
340 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1429  ABC transporter related  41.75 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.152844  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  36.64 
 
 
302 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0591  ABC transporter related  29.77 
 
 
321 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  39.04 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 
321 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.88 
 
 
342 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.08 
 
 
338 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.43 
 
 
335 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.71 
 
 
350 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.76 
 
 
347 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.47 
 
 
330 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  35.49 
 
 
3786 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
275 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.13 
 
 
322 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
328 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.75 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  35.69 
 
 
312 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 
319 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
334 aa  139  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.94 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  32.27 
 
 
339 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  32.27 
 
 
339 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  31.61 
 
 
339 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.02 
 
 
345 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
322 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  32.59 
 
 
339 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.91 
 
 
316 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.09 
 
 
334 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.99 
 
 
339 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.55 
 
 
332 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.28 
 
 
313 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  32.38 
 
 
340 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  39.82 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  32.92 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  26.5 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2896  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
339 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  33.65 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  33.47 
 
 
244 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.49 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  41.36 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  32.71 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  38.56 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.34 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1099  ABC transporter related  39.06 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  hitchhiker  0.000176016 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  29.69 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  28.44 
 
 
337 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.53 
 
 
446 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  37.71 
 
 
337 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  32.38 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1840  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.6 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  30.6 
 
 
311 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
351 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  29.69 
 
 
338 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  28.12 
 
 
337 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.76 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
262 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 
244 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.34 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.57 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0617  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.62 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899529  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  33.04 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1756  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.09 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215273  hitchhiker  0.00900194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  28.94 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.81 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.71 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1383  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.16 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.895851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  31.91 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  28.62 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
312 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 
312 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.72 
 
 
328 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  35.68 
 
 
305 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  33.04 
 
 
244 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  38.57 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  32.65 
 
 
244 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  30.7 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>