183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  100 
 
 
420 aa  826    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  52.31 
 
 
408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  52.86 
 
 
407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  54.32 
 
 
409 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  49.48 
 
 
372 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  46.78 
 
 
416 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  50.87 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  48.39 
 
 
394 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  50.26 
 
 
389 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  47.5 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  47.36 
 
 
399 aa  298  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  49.64 
 
 
429 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  45.43 
 
 
385 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  47.07 
 
 
395 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  47.07 
 
 
401 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  44.19 
 
 
391 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  47.16 
 
 
403 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  49.33 
 
 
379 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  48.68 
 
 
376 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  44.86 
 
 
418 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  46.28 
 
 
373 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  43.39 
 
 
400 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  37.5 
 
 
386 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  37.08 
 
 
386 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  39.18 
 
 
383 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  37.91 
 
 
383 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  35.81 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  35.81 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  35.81 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  35.81 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  37.44 
 
 
388 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  40 
 
 
383 aa  226  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  37.37 
 
 
383 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  37.37 
 
 
383 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  37.37 
 
 
383 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  38.01 
 
 
385 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  35.62 
 
 
382 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  35.55 
 
 
382 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  34.11 
 
 
387 aa  222  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  37 
 
 
398 aa  220  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  33.94 
 
 
404 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  38.73 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  34.72 
 
 
387 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  36.39 
 
 
405 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  37.85 
 
 
359 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  36.06 
 
 
392 aa  216  9e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  34.87 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  35.88 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  35.04 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  35.04 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  35.04 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  42.51 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  36.15 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  36.13 
 
 
385 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  33.6 
 
 
387 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  35.91 
 
 
409 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  36.43 
 
 
391 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  34.88 
 
 
389 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  33.07 
 
 
380 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  38.32 
 
 
349 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  34.02 
 
 
384 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  36.79 
 
 
385 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  41.53 
 
 
362 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  31.76 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  35.08 
 
 
379 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  36.91 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  31.46 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  31.76 
 
 
387 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  38.22 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  37.73 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  34.66 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  31.33 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  35.23 
 
 
391 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  37.29 
 
 
414 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  32.72 
 
 
392 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  31 
 
 
392 aa  195  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  33.77 
 
 
386 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  39.07 
 
 
390 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  33.43 
 
 
395 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  31.87 
 
 
385 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  31.62 
 
 
386 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  36.03 
 
 
388 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  38.48 
 
 
349 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  34.2 
 
 
389 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  33.25 
 
 
390 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  32.45 
 
 
397 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  34.63 
 
 
388 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  30.89 
 
 
386 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  33.07 
 
 
396 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  35.08 
 
 
356 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  37.71 
 
 
348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  35.89 
 
 
369 aa  183  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  34.43 
 
 
358 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  34.55 
 
 
394 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  30.65 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  33.14 
 
 
350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  33.74 
 
 
355 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>