More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3250 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 249 aa  517  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  91.57 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  91.57 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  91.16 
 
 		 249 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  91.57 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  91.57 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  91.16 
 
 		 249 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  89.56 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  89.16 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  88.76 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  77.51 
 
 		 249 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 272 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  35.22 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  31.56 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.83 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  30.22 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  28.37 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  30.77 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  29.58 
 
 		 705 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 241 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.64 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.35 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  29.41 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  29.41 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.72 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  28.4 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  28.45 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.13 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27.13 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45294  predicted protein  26.3 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.91 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.72 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.45 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.88 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  26.64 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.32 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.62 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.07 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  27.64 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>