42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1130 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  289  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  90.28 
 
 
144 aa  269  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  89.58 
 
 
144 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  88.89 
 
 
144 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  87.5 
 
 
144 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  86.11 
 
 
144 aa  253  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  81.94 
 
 
144 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  71.53 
 
 
177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  70.14 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  70.14 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  70.14 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  70.14 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  70.14 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  70.14 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  70.14 
 
 
144 aa  206  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  48.61 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  49.31 
 
 
141 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  40.97 
 
 
187 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  40.28 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  33.8 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  33.79 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.29 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.29 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.29 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
170 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  29.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4157  putative universal stress protein UspA  35.42 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.99 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
887 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
887 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  29.66 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  27.78 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.5 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  24.31 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  26.39 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>