67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4495 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  92.34 
 
 
248 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  92.34 
 
 
248 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  92.34 
 
 
288 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  89.52 
 
 
248 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  89.11 
 
 
248 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  65.73 
 
 
259 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  65.73 
 
 
248 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  65.73 
 
 
248 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  65.73 
 
 
248 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  65.32 
 
 
259 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  64.92 
 
 
248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  66.94 
 
 
304 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  46.69 
 
 
261 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  34.52 
 
 
278 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  35.25 
 
 
278 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  30.08 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  32.24 
 
 
261 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  30.87 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  29.91 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  31.76 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  31.2 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  26.94 
 
 
223 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  27.62 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  27.97 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  27.12 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  27.12 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  29.79 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  27.12 
 
 
378 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  26.69 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  26.45 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  28.15 
 
 
864 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  26.45 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  26.45 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  24.47 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  25.42 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  26.12 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  27.82 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  25.11 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  28.87 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  26.16 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  25.61 
 
 
225 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  25.65 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  28.79 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.51 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  23.89 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  23.85 
 
 
299 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  27.45 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  24.42 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  33.33 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  25.93 
 
 
285 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  25.73 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  21.95 
 
 
274 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  36.25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  23.72 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  35 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25.93 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  24.24 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  25.49 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  28.4 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  34.15 
 
 
491 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  33.8 
 
 
278 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>