More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5887 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  94.03 
 
 
419 aa  770    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  92.6 
 
 
420 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  97.14 
 
 
419 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
419 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  97.14 
 
 
419 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  90.45 
 
 
418 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  91.89 
 
 
420 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  74.69 
 
 
420 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  66.41 
 
 
421 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.73 
 
 
411 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  53.66 
 
 
415 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  53.72 
 
 
415 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.87 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  51.6 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  51.34 
 
 
403 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  51.6 
 
 
403 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1907  cytochrome c, class I  51.45 
 
 
411 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551897  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3169  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.13 
 
 
494 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0153486  hitchhiker  0.0000801233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  44.65 
 
 
416 aa  342  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.33 
 
 
430 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.07 
 
 
426 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.2 
 
 
430 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.47 
 
 
430 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  44.07 
 
 
429 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.07 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  41.27 
 
 
419 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  40.51 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
432 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  39.24 
 
 
432 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.83 
 
 
447 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  40.21 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  40.21 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.78 
 
 
432 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  39.04 
 
 
421 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  39.43 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.21 
 
 
432 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  38.27 
 
 
432 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  39 
 
 
427 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.39 
 
 
434 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  37.44 
 
 
432 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.22 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  38.22 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  38.22 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.44 
 
 
448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  39.26 
 
 
428 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.5 
 
 
461 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.44 
 
 
432 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.96 
 
 
432 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  37.96 
 
 
432 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  38.75 
 
 
469 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.74 
 
 
426 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.57 
 
 
680 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 
434 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  38.97 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.39 
 
 
434 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 
425 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  38.52 
 
 
407 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.09 
 
 
436 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  40.66 
 
 
434 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  40.66 
 
 
434 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  36.96 
 
 
718 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  40.15 
 
 
432 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  40.15 
 
 
432 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 
432 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.57 
 
 
461 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  36.61 
 
 
468 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  40.62 
 
 
432 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.9 
 
 
441 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.32 
 
 
723 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  39.9 
 
 
439 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.1 
 
 
395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  35.6 
 
 
429 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.34 
 
 
429 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  35.49 
 
 
669 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  40.15 
 
 
482 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  40.66 
 
 
650 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  40.15 
 
 
476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.92 
 
 
422 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.3 
 
 
453 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.07 
 
 
474 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.22 
 
 
440 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  36 
 
 
424 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36 
 
 
424 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.19 
 
 
447 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  38.41 
 
 
501 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  38.62 
 
 
438 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  37.81 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3373  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.36 
 
 
421 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.04 
 
 
444 aa  243  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  36.6 
 
 
463 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.01 
 
 
420 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.5 
 
 
447 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.48 
 
 
450 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  39.14 
 
 
447 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>