More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1223 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  99.69 
 
 		 318 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  98.11 
 
 		 318 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  99.69 
 
 		 318 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2065  LysR family transcriptional regulator  97.17 
 
 		 318 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1130  LysR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 318 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1142  LysR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 318 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1152  LysR family transcriptional regulator  83.28 
 
 		 320 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2081  LysR family transcriptional regulator  82.97 
 
 		 320 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1144  LysR family transcriptional regulator  83.28 
 
 		 320 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2533  LysR family transcriptional regulator  82.97 
 
 		 320 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1305  LysR family transcriptional regulator  82.65 
 
 		 320 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0699  LysR family transcriptional regulator  82.65 
 
 		 320 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  73.82 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  73.82 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  73.82 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  73.82 
 
 		 323 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0099  LysR family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 277 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1101  LysR family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 277 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0325  LysR family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 277 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3902  LysR family transcriptional regulator  63.67 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3898  LysR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2032  LysR family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2847  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2070  LysR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7812  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4670  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  hitchhiker  0.00186288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1244  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0599  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0475  transcriptional regulator, LysR family  22.26 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0927  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  23.73 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 289 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  22.8 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.12 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.47 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.47 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.47 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.12 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.12 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  24.41 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4911  transcriptional regulator, LysR family  22.79 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  26.4 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0974  transcriptional regulator, LysR family  23.86 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.966458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  23.27 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3390  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  19.66 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  19.66 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5283  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4985  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3084  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  22.68 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0953  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  26.19 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0988  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  26.19 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3437  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.657554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>