38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0874 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  95.15 
 
 		 330 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  95.15 
 
 		 330 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  58.65 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  54.34 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  51.32 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  48.4 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  51.52 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  47.08 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  48.03 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  39.45 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  38.97 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  37 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  37.29 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  37.29 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  37.75 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  36.33 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  36.27 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  51.55 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  38.13 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  37.07 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  35.06 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  30.54 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  28.57 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  27.72 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  27.15 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  28.71 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  30.68 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0180  Domain of unknown function DUF1814  30.12 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.125198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  29.14 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  30.69 
 
 		 255 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>