More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3224 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3224  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.911223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4936  Pirin-like  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5536  pirin domain-containing protein  77.87 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5776  pirin domain-containing protein  74.89 
 
 		 235 aa  357  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  51.71 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  42.49 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  42.49 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  42.92 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  39.48 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  42.06 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  39.66 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  40.09 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  39.22 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  39.5 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  37.93 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  41.38 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  40.09 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  41.81 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  39.22 
 
 		 232 aa  157  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  39.06 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  40.26 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  37.93 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  40.34 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  38.63 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  38.2 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  37.77 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  40.17 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  37.77 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  39.08 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  39.32 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  40.17 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  29.29 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  27.73 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  31.84 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  33.64 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  29.18 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  28.76 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  28.76 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  28.76 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  28.76 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  31.34 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3096  Pirin domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  32.75 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  27.7 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  31.34 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  27.47 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  29.67 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  26.38 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  26.38 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  32.31 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  30.8 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  27.47 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  26.76 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  27.16 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  27.47 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  27.16 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  33.91 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  28.11 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  30.69 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  27.23 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  26.29 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  29.03 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  26.54 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  27.16 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  29.26 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  27.16 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  27.16 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  28.27 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  26.54 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  29.35 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  29.21 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  29.44 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  29.65 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0520  pirin domain-containing protein  26.94 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  28.57 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  30.05 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  29.03 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  28.64 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  31.03 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  30.05 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  27.54 
 
 		 232 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  30.41 
 
 		 356 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  26.72 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  26.29 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2313  pirin domain-containing protein  34.08 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  27.59 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  27.06 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2448  pirin domain-containing protein  33.52 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53622  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  28.89 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  30.25 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  27.65 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>