46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4143 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  100 
 
 		 397 aa  771    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  57.4 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  43.91 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  48.75 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  45.87 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  49.53 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  43.51 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  42.52 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  39.47 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  39.02 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  39.43 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  40.46 
 
 		 417 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  39.76 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  36.1 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  32.87 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  36.63 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  28.33 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  27.4 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  28.45 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  28.27 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  31.21 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  30.81 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  28.85 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  30.2 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  30.32 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  29.5 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  31.62 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  27.08 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  28.72 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  27.53 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  29.86 
 
 		 251 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  28.49 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  25.67 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  26.71 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  26.74 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  27.04 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.5 
 
 		 752 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  26.8 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  22.82 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  22.82 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  28.02 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  27.03 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  27.14 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  27.89 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  23.16 
 
 		 537 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  26.89 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>