53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3763 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3763  YCII-related protein  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0227  YCII-related protein  41.94 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  40.34 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  35.65 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  40.62 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  34.82 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  37.84 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  25.83 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  31.3 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  34.51 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.32 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  32.43 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  29.09 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  25.62 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  30.09 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  30.63 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  31.58 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  33.62 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  34.82 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  34.21 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 260 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  31.3 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  27.93 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  34.04 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.63 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  29.46 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.63 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  31.53 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  34.67 
 
 		 119 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  31.53 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  31.53 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  32.46 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  28.95 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  32.98 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  32.18 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  25.45 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  40.3 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  26.79 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  34.57 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  33.04 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  29.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  38.57 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  31.15 
 
 		 128 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  35.53 
 
 		 122 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>