243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3537 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  100 
 
 
331 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  43.56 
 
 
312 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  43.6 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  38.99 
 
 
312 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.62 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.75 
 
 
310 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  38.44 
 
 
315 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.1 
 
 
307 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.79 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  38.57 
 
 
314 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  30.06 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  30.06 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  42.26 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  43.56 
 
 
301 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.48 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  41.16 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  39.27 
 
 
316 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  28.93 
 
 
311 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  40.32 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  36.13 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  30.23 
 
 
286 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  39.14 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.95 
 
 
308 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.66 
 
 
315 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.25 
 
 
310 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 
315 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  39.6 
 
 
353 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  34.66 
 
 
315 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  34.66 
 
 
315 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.59 
 
 
310 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.4 
 
 
306 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.12 
 
 
304 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  24.7 
 
 
308 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  30.59 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.03 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  37.75 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  36.45 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 
310 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 
310 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  29.01 
 
 
318 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.53 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  36.01 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 
304 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  27.99 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  34.67 
 
 
312 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  31.16 
 
 
303 aa  116  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  27.95 
 
 
303 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  34.58 
 
 
310 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  32.52 
 
 
313 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 
332 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.18 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  24.67 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  37.25 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  37.82 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  38.03 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  34.57 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  36.51 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  28.09 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  33.02 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  28.09 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 
332 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  27.95 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 
306 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  33.81 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  28.88 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  28.81 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.18 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.04 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  32.82 
 
 
315 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 
325 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  27.95 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  36.67 
 
 
322 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  27.52 
 
 
311 aa  109  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  35.85 
 
 
312 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  28.44 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  30.41 
 
 
303 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 
312 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 
312 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 
303 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 
312 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  32 
 
 
312 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  32.52 
 
 
306 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  30.56 
 
 
319 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  35 
 
 
314 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  33.74 
 
 
312 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01950  1-phosphofructokinase  39.56 
 
 
322 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.960297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>