More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2908 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  100 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  72.5 
 
 		 203 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.35 
 
 		 211 aa  255  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.63 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.48 
 
 		 206 aa  227  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.67 
 
 		 201 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.08 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.71 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.7 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.64 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.47 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  56.16 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  55.72 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  53.69 
 
 		 203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.05 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.83 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.02 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  39.02 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.54 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.28 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  36.76 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  36.1 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  36.1 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.94 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.85 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.98 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.98 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.88 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.96 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.5 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.82 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.76 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  34.3 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.15 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.1 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  35.44 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.81 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.76 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.9 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  34.95 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  34.29 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.44 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.1 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  38.5 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.5 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.84 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  32.51 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  31.53 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  31.53 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.71 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.14 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.07 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  31.53 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.5 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.9 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.16 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  34.31 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  35.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.16 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  32.02 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  32.02 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  32.02 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  32.02 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  34.31 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  32.38 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  32.38 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  33.67 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.83 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.99 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.83 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.05 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  31.96 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.9 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  30.48 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.05 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  33.17 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.84 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.9 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  28.93 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>