119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5790 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5790  membrane protein-like protein  100 
 
 		 333 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162832  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5562  membrane protein-like protein  83.48 
 
 		 333 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  66.57 
 
 		 335 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  51.94 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5442  hypothetical protein  47.81 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564208  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  36.19 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  26.74 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  26.42 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  26.06 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  24.77 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  24.04 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  25.53 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  23.89 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  26.47 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  24.69 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  22.67 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  22.39 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  24.84 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  25.67 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  25.67 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  26.13 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  26.13 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  26.13 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  26.13 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  26.13 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.19 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  26.13 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  25.78 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  23.08 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  22.3 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  26.3 
 
 		 272 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  26.8 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  23.42 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  22.92 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  22.62 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  22.73 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  23.33 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  26.91 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  23.05 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  27.81 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  25.95 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  24.84 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  23.26 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  21.62 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  23.97 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  25.63 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  24.55 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  22.19 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  25.26 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  23.31 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  23.47 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  23.43 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  21.41 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  24.82 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  23.22 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  25.55 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  24.83 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  24.48 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  24.48 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  24.27 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  23.08 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  21.79 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  20.93 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  25.9 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  23.08 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  24.2 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  22.22 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  22.22 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  22.22 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  23.53 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  21.48 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  21.18 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  23.13 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  21.48 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  20.42 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  22.89 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  23.76 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  24.91 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  20.42 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  22.68 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  19.93 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  23.27 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  24.54 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  21.35 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  19.62 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  24.29 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  21.14 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  20.35 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3534  hypothetical protein  25.09 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  20.83 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  23.33 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  22.54 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  20.08 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  27.67 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  21.45 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  24.65 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  24.65 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  24.65 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  24.65 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  24.65 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>